MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 1703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013207	CGT	2	6	28111	28116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793066
502	NC_013207	CCT	2	6	28143	28148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793066
503	NC_013207	TCC	2	6	28152	28157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793066
504	NC_013207	GAT	2	6	28175	28180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793066
505	NC_013207	GGT	2	6	28189	28194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793066
506	NC_013207	TCGAA	2	10	28205	28214	40 %	20 %	20 %	20 %	257793066
507	NC_013207	ACC	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793066
508	NC_013207	GAT	2	6	28244	28249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793066
509	NC_013207	TTG	2	6	28250	28255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793066
510	NC_013207	TCT	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793066
511	NC_013207	ATC	2	6	28312	28317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013207	GCT	2	6	28354	28359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013207	CGG	2	6	28372	28377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013207	TGAG	2	8	28545	28552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013207	GCTG	2	8	28618	28625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_013207	GAA	2	6	28648	28653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013207	GAA	2	6	28789	28794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013207	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013207	T	6	6	28902	28907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013207	CG	3	6	28940	28945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_013207	ACAA	2	8	28958	28965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_013207	ATG	2	6	28974	28979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013207	GA	3	6	28984	28989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013207	TTC	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013207	ATA	2	6	29036	29041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013207	GA	3	6	29051	29056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013207	CT	3	6	29068	29073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013207	AGG	2	6	29151	29156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013207	GGA	3	9	29223	29231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793067
530	NC_013207	GA	3	6	29247	29252	50 %	0 %	50 %	0 %	257793067
531	NC_013207	ATG	2	6	29258	29263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793067
532	NC_013207	GAAA	2	8	29388	29395	75 %	0 %	25 %	0 %	257793067
533	NC_013207	TA	3	6	29406	29411	50 %	50 %	0 %	0 %	257793067
534	NC_013207	A	7	7	29483	29489	100 %	0 %	0 %	0 %	257793067
535	NC_013207	TTCG	2	8	29505	29512	0 %	50 %	25 %	25 %	257793067
536	NC_013207	ACA	2	6	29594	29599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793067
537	NC_013207	AAG	2	6	29602	29607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793067
538	NC_013207	TGA	2	6	29646	29651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793067
539	NC_013207	ATC	2	6	29662	29667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793067
540	NC_013207	C	6	6	29710	29715	0 %	0 %	0 %	100 %	257793067
541	NC_013207	GCGG	2	8	29745	29752	0 %	0 %	75 %	25 %	257793067
542	NC_013207	ATT	2	6	29785	29790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793067
543	NC_013207	GTA	2	6	29798	29803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793067
544	NC_013207	TAT	2	6	29808	29813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793067
545	NC_013207	AG	3	6	29878	29883	50 %	0 %	50 %	0 %	257793068
546	NC_013207	AGC	2	6	29907	29912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793068
547	NC_013207	AATC	2	8	29938	29945	50 %	25 %	0 %	25 %	257793068
548	NC_013207	AGG	2	6	29966	29971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793068
549	NC_013207	AT	3	6	29977	29982	50 %	50 %	0 %	0 %	257793068
550	NC_013207	ATT	2	6	30002	30007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793068
551	NC_013207	ACAG	2	8	30020	30027	50 %	0 %	25 %	25 %	257793068
552	NC_013207	CAA	2	6	30224	30229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793068
553	NC_013207	AAC	2	6	30334	30339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793068
554	NC_013207	ATG	2	6	30463	30468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793068
555	NC_013207	ATC	2	6	30529	30534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793068
556	NC_013207	AGA	2	6	30546	30551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793068
557	NC_013207	TGAA	2	8	30623	30630	50 %	25 %	25 %	0 %	257793068
558	NC_013207	CAT	2	6	30719	30724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793068
559	NC_013207	AAG	2	6	30761	30766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793068
560	NC_013207	TCAT	2	8	30812	30819	25 %	50 %	0 %	25 %	257793068
561	NC_013207	GC	4	8	30846	30853	0 %	0 %	50 %	50 %	257793068
562	NC_013207	GAACG	2	10	30898	30907	40 %	0 %	40 %	20 %	257793068
563	NC_013207	AGT	2	6	30963	30968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793068
564	NC_013207	CAT	2	6	31144	31149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793068
565	NC_013207	TCAT	2	8	31235	31242	25 %	50 %	0 %	25 %	257793068
566	NC_013207	AGT	2	6	31269	31274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793068
567	NC_013207	CTG	2	6	31364	31369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013207	CGG	2	6	31396	31401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013207	A	6	6	31405	31410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013207	GCA	2	6	31431	31436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013207	ATG	2	6	31483	31488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013207	TCCA	2	8	31540	31547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_013207	GCATC	2	10	31588	31597	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
574	NC_013207	GGA	2	6	31647	31652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013207	CCA	2	6	31679	31684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_013207	GAG	2	6	31686	31691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013207	ACG	2	6	31706	31711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793069
578	NC_013207	GCT	2	6	31715	31720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793069
579	NC_013207	CGG	2	6	31722	31727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793069
580	NC_013207	GGT	2	6	31743	31748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793069
581	NC_013207	ATC	2	6	31756	31761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793069
582	NC_013207	GTT	2	6	31767	31772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793069
583	NC_013207	TCC	2	6	31902	31907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_013207	CTT	2	6	31930	31935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013207	GTT	2	6	31938	31943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013207	A	6	6	31954	31959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013207	TGG	2	6	32001	32006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013207	TCT	2	6	32032	32037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013207	TGGA	2	8	32042	32049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013207	TTTG	2	8	32067	32074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013207	CCCT	2	8	32087	32094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
592	NC_013207	GAG	2	6	32107	32112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013207	GGT	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793070
594	NC_013207	GAA	2	6	32175	32180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793070
595	NC_013207	GAT	2	6	32190	32195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793070
596	NC_013207	ACC	2	6	32203	32208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793070
597	NC_013207	TCCC	2	8	32247	32254	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
598	NC_013207	ACG	2	6	32277	32282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013207	GTT	2	6	32392	32397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013207	GAT	2	6	32414	32419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013207	GAC	2	6	32456	32461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013207	TTCC	2	8	32480	32487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013207	GGC	2	6	32511	32516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013207	CTCGG	2	10	32577	32586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
605	NC_013207	CTC	2	6	32745	32750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_013207	GCA	2	6	32784	32789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013207	GATG	2	8	32919	32926	25 %	25 %	50 %	0 %	257793071
608	NC_013207	CAC	2	6	32942	32947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793071
609	NC_013207	GATAT	2	10	33004	33013	40 %	40 %	20 %	0 %	257793071
610	NC_013207	TGG	2	6	33023	33028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793071
611	NC_013207	ATTC	2	8	33064	33071	25 %	50 %	0 %	25 %	257793071
612	NC_013207	ATTG	2	8	33114	33121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013207	TGT	2	6	33135	33140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013207	TGA	2	6	33145	33150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013207	ATC	2	6	33157	33162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013207	CATCGC	2	12	33170	33181	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
617	NC_013207	CGT	2	6	33186	33191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013207	AG	3	6	33225	33230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013207	AACG	2	8	33252	33259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_013207	GAAT	2	8	33307	33314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013207	CTT	3	9	33376	33384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013207	TGCC	2	8	33438	33445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_013207	TGA	2	6	33577	33582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013207	AGCGA	2	10	33604	33613	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_013207	CAAG	2	8	33724	33731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013207	CCA	2	6	33748	33753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013207	TTG	2	6	33790	33795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013207	TCGA	2	8	33850	33857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_013207	GCA	2	6	33865	33870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013207	GTCGT	2	10	33904	33913	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
631	NC_013207	TGCC	2	8	33961	33968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_013207	CG	3	6	33985	33990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_013207	GA	3	6	34065	34070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013207	TGC	2	6	34080	34085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013207	CGA	3	9	34108	34116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013207	AACG	2	8	34142	34149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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